万方查重是一款专业的文献查重工具，主要应用于学术领域。其检测速度快，准确率高，支持多种文献格式，使用方便。但是，万方查重的文献库相对较小，覆盖范围有限，可能无法检测到一些国外文献或特殊领域的文献。知网对比分析则是知网旗下的文献查重工具，覆盖范围广，包含了大量国内外文献资源，能够全面检测文献的原创性。但是，知网对比分析的收费较高，对个人用户来说可能成本较高。因此，在选择使用万方查重还是知网对比分析时，需要根据自身需求和经济承受能力进行权衡。

从功能和价格两个方面来看，万方查重和知网对比分析各有优劣。万方查重在速度和准确率上表现出色，适合对学术论文进行查重，但文献库相对较小；知网对比分析覆盖范围广，能够检测到更多的文献资源，但价格较高。因此，如果您对文献查重的要求比较高且经济实力允许，可以选择知网对比分析；如果只是简单查重或对价格比较敏感，万方查重可能会是更好的选择。